Die wärmsten Monate sind normalerweise September und Oktober, dann liegt die Durchschnittstemperatur bei 25 °C. Die kältesten Monate sind Juli und Juni mit einer Durchschnittstemperatur von 22 °C. In San Borja fällt der meiste Regen im Februar, Januar, März und Dezember, mit einer durchschnittlichen Niederschlagsmenge von 580 mm pro Monat.